Ingénieur-e d’études (H/F) en biologie dans un projet collaboratif transdisciplinaire sur la détection et le rôle des énantiomères D d’acides aminés dans les îlots pancréatiques et la physiopathologie du diabète – CDD de 2 ans à Bordeaux

Job title:

Ingénieur-e d’études (H/F) en biologie dans un projet collaboratif transdisciplinaire sur la détection et le rôle des énantiomères D d’acides aminés dans les îlots pancréatiques et la physiopathologie du diabète – CDD de 2 ans à Bordeaux

Company:

CNRS

Job description

Français :
L’asymétrie est une caractéristique fondamentale à la base de la chiralité et de nombreux phénomènes physiologiques. Nous cherchons un/e candidat/e IE pour le versant biologie/physiologie de notre projet interdisciplinaire.Bien que la plupart des acides aminés soient des énantiomères L, les acides aminés D (D-AA) sont présents chez les mammifères et les humains et sont impliqués dans de nombreux mécanismes vitaux allant de la fonction neuronale à l’homéostasie du glucose. Des altérations de leurs concentrations ont été liées à des maladies chroniques majeures telles que la maladie d’Alzheimer ou le diabète (type 2). Des connaissances approfondies sur les D-AA font défaut, car leur détection est actuellement lourde, techniquement très exigeante et nécessite des préparations d’échantillons, empêchant une un suivi en continu.Notre proposition aborde un problème fondamental, à savoir la détection et la quantification d’énantiomères online par des capteurs OECTs (Organic Electrochemical Transistors) afin de comprendre l’importance physiologique et biomédicale de ces énantiomères pour la santé et dans certaines maladies. L’approche proposée et le capteur qui en résulte sont nouveaux et peuvent constituer une percée générale majeure en analytique et en biomédecine.Les objectifs généraux du projet sont de : 1) développer de nouveaux polymères chiraux par électropolymérisation 2), élaborer des capteurs nanostructurés dans 3) un dispositif multiparamétrique énantiosélectif et 4) obtenir une preuve de concept pour les capteurs permettant l’investigation physiologique et physiopathologique dans un micro-organe pertinent en biomédecine, l’îlot pancréatique de Langerhans. Ce micro-organe est en effet un « mini-cerveau », électriquement excitable et au cœur de l’homéostasie des nutriments et du diabète.Pour ce faire, le consortium de ce projet ANR (ANR-23-CE42-0004 CHIRA-SENSEO) combine des expertises de 4 laboratoires en chimie des polymères, électrochimie et nanostructuration, physique et développement de dispositifs et biologie/électrophysiologie.Pour mener à bien, en interaction avec les autres partenaires, l’objectif 4 de ce projet ANR qui concerne la partie biologique, nous recrutons un-e Ingénieur-e d’Etudes en biologie pour un CDD de deux ans.English:
Asymmetry is a fundamental feature underlying chirality and many physiological phenomena. We are looking for an Engineer (IE) to contribute to the biological and physiological aspects of our interdisciplinary project.Although most amino acids exist as L-enantiomers, D-amino acids (D-AAs) are also present in mammals and humans, playing key roles in various vital mechanisms, from neuronal function to glucose homeostasis. Alterations in their concentrations have been linked to major chronic diseases such as Alzheimer’s disease and type 2 diabetes. However, in-depth knowledge of D-AAs remains limited, as their detection is currently complex, technically demanding, and requires extensive sample preparation, preventing real-time monitoring.Our project addresses a fundamental challenge: the real-time detection and quantification of enantiomers using Organic Electrochemical Transistor (OECT) sensors to better understand their physiological and biomedical importance in health and disease. The proposed approach and resulting sensor technology are novel and could represent a major breakthrough in analytical science and biomedicine.The project’s main objectives are to:
1- Develop new chiral polymers via electropolymerization,
2- Design nanostructured sensors,
3- Integrate them into a multiparametric enantioselective device,
4- Provide proof-of-concept for these sensors in physiological and pathophysiological studies, using the pancreatic islet of Langerhans as a model micro-organ. This micro-organ functions as a “mini-brain,” is electrically excitable, and plays a crucial role in nutrient homeostasis and diabetes.This ANR-funded project is a collaborative effort between four research laboratories specialized in polymer chemistry, electrochemistry and nanostructuring, materials science and biology/electrophysiology.To achieve the biological objective (Objective 4) of the ANR project (ANR-23-CE42-0004 CHIRA-SENSEO), we are recruiting an Engineer in Biology for a 2-year fixed-term contract.ActivitésFrançais :
Les activités de la personne recrutée dans ce projet seront :
Tâche 1 : En collaboration avec les autres partenaires du projet, la personne recrutée mettra au point l’ensemencement et la culture d’îlots de souris et humains primaires sur les dispositifs OECT énantio-sélectifs. Elle appliquera variations physiologiques de nutriments, en microfluidique, et mesurera, dans ces conditions et grâce à ces dispositifs, les cinétiques de libération des D-AA, de même que l’activité électrique globale de ces micro-organes sur des OECT « contrôle » comme nous l’avons déjà publié.
Tâche 2 : Des îlots de souris invalidées génétiquement pour la racémase (qui convertit les L-AA and D-AA) seront utilisés pour vérifier la spécificité de l’approche, de même que des îlots transduits avec la chaine légère de la toxine tétanique qui réduit significativement l’exocytose dans ces cellules (validé au laboratoire).
Tâche 3 : L’impact de conditions physiopathologiques sur la libération de D-AA par les îlots sera étudiée : application de conditions de culture diabétogènes (excès prolongé de glucose), îlots humains issus de patients diabétiques (type 2), voire modèles d’îlots humains dérivés de cellules souches iPSC humaines portant une mutation humaine (collaboration avec un laboratoire belge reconnu sur les iPSC en cours).English:
Missions/Tasks:
Task 1: In collaboration with project partners, the recruited engineer will establish the seeding and culture of primary mouse and human pancreatic islets on enantioselective OECT devices. He/she will apply physiological nutrient variations using microfluidic systems and measure D-AA release kinetics as well as global electrical activity of these micro-organs using control OECTs, as previously published by our group.
Task 2: Mouse islets with genetic deletion of racemase (which converts L-AAs to D-AAs) will be used to validate the specificity of the approach. Additionally, islets transduced with the light chain of tetanus toxin-known to significantly reduce exocytosis in these cells (validated in our lab)-will be studied.
Task 3: The impact of pathophysiological conditions on D-AA release will be investigated, including diabetic culture conditions (prolonged high glucose exposure), human islets from type 2 diabetic patients, and human iPSC-derived islet models carrying diabetes-associated mutations (in collaboration with a renowned Belgian laboratory in iPSC research).

CompétencesFrançais :
La personne retenue aura un fort intérêt pour le travail et les interactions transdisciplinaires. Elle maitrisera la culture cellulaire, y compris de cellules primaires, éventuellement la transduction virale et les dosages d’hormones (ELISA ou HTRF). Elle maitrisera ou sera intéressée d’apprendre, l’isolement d’îlots pancréatiques de souris, l’électrophysiologie extracellulaire et la microfluidique appliquée à la biologie.
Elle possèdera au moins un Master 2 ou un diplôme d’ingénieur (Bac +5) en biologie cellulaire, physiologie, physiopathologie, biotechnologies pour la santé ou nutrition. Certaines personnes travaillant en CDD dans le projet étant anglophones, la personne recrutée sera capable de suivre les grandes lignes d’un échange scientifique et de présenter ses résultats en anglais.English:
The selected candidate will have a strong interest in transdisciplinary work and interactions. He/she will have expertise in cell culture, including primary cells, and possibly viral transduction and hormone assays (ELISA or HTRF). He/she will be proficient in, or willing to learn, mouse pancreatic islet isolation, extracellular electrophysiology, and microfluidics applied to biology.
Educational background:
Master’s degree (MSc) or an engineering degree (Bac +5) in cell biology, physiology, pathophysiology, biomedical technologies, or nutrition.Contexte de travailFrançais :
L’Ingénieur-e d’Etudes (IE) travaillera dans le groupe Biologie Cellulaire & Biocapteurs (2 Professeurs, 1 Maître de Conférences, 1 IE et 1 Assistant Ingénieur permanents, 1 IE en CDD, 1 postdoctorant et 3 doctorants) à l’Institut de Chimie & Biologie des Membranes & Nano-objets, UMR5248, CNRS, Université de Bordeaux. Le laboratoire est situé dans la ville de Pessac, dans le sud-ouest de la France, sur le campus universitaire de Bordeaux, à seulement 15 minutes en tramway du centre-ville de Bordeaux.
Nous disposons de tous les équipements, de l’accès au matériel biologique, et d’une vaste expertise sur la biologie des îlots (Jaffredo et al., Diabetes 2021, 2024), les îlots-sur-puces microfluidiques (Lallouet et al., Lab Chip 2025 ; Raoux et al., Transpl Int 2023 ; Perrier et al., Biosens Bioelectron 2018 ) et les dispositifs OECT (Abarkan et al., Adv Sci 2022).
Le contrat prévu est de 2 ans, suivant les grilles salariales du CNRS, en tenant compte de l’ancienneté éventuelle, avec possibilité de prolongation en fonction des nouveaux contrats de recherche acquis par l’équipe et si le travail donne satisfaction.
La candidature comprendra un CV complet avec une liste de publications et/ou de preprints (bioRxiv) s’il y en a, une lettre de motivation, des références, et une ou deux lettres de recommandation.English:
The selected candidate will have a strong interest in transdisciplinary work and interactions. He/she will have expertise in cell culture, including primary cells, and possibly viral transduction and hormone assays (ELISA or HTRF). He/she will be proficient in, or willing to learn, mouse pancreatic islet isolation, extracellular electrophysiology, and microfluidics applied to biology.
The Engineer will join the Cell Biology & Biosensors Group (comprising 2 Professors, 1 Associate Professor, 1 Permanent Engineer, 1 Permanent Assistant Engineer, 1 Fixed-Term Engineer, 1 Postdoctoral Researcher, and 3 PhD students) at the Institute of Chemistry & Biology of Membranes & Nano-Objects (UMR 5248, CNRS, University of Bordeaux).
The laboratory is located in Pessac, southwestern France, on the Bordeaux university campus, just 15 minutes by tram from downtown Bordeaux. We have all necessary equipment, access to biological materials, and extensive expertise in: islet biology (Jaffredo et al., Diabetes 2021, 2024), microfluidic islet-on-chip systems (Lallouet et al., Lab Chip 2025; Raoux et al., Transpl Int 2023; Perrier et al., Biosens Bioelectron 2018), OECT recordings on islets (Abarkan et al., Adv Sci 2022).
This is a 2-year contract, following CNRS salary scales and taking into account previous experience. Extension may be possible, depending on future research funding and performance.
Application requirements:
-A cover letter
-A complete CV (including publications and/or preprints on bioRxiv if available)
-References
-One or two recommendation lettersContraintes et risquesRASInformations complémentairesce recrutement a lieu dans le cadre de l’ANR-23-CE42-0004 CHIRA-SENSEO

Expected salary

€2472.42 per month

Location

Bordeaux, Gironde

Job date

Thu, 27 Feb 2025 05:34:43 GMT

To help us track our recruitment effort, please indicate in your email/cover letter where (vacanciesineu.com) you saw this job posting.