Chercheur postdoctoral (H/F) – machine learning, developmental biology, modeling

Job title:

Chercheur postdoctoral (H/F) – machine learning, developmental biology, modeling

Company:

CNRS

Job description

Rejoindre le nouveau projet ERC NOVELTEETH porté par Alexa SADIER à l’Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier (ISE-M) en tant que chercheur postdoctoral. Ce projet vise à comprendre l’origine et la diversification d’une innovation majeure chez les mammifères – les classes de dents – du génotype au phénotype à l’aide d’approches interdisciplinaires. Pour ce faire, vous travaillerez sur des données morphologiques et transcriptomiques chez les adultes et les embryons de plusieurs espèces de chauves-souris de différentes niches écologiques à l’aide d’approches innovantes. A terme, vous étendrez ces résultats à d’autres mammifères. Ce poste offre une occasion unique d’utiliser des données morphologiques et développementales à l’aide de techniques de pointe tant sur le terrain qu’en laboratoire.ActivitésL’objectif proximal est de déterminer précisément les signatures morphologiques et transcriptomiques de chaque classe de dent (incisives, canines, prémolaires et molaires) chez les chauves-souris afin de généraliser ces signatures aux mammifères. L’objectif secondaire est de comparer l’adaptation des dents avec les adaptations alimentaires pour d’autres organes tels que les glandes salivaires. Vous aurez également l’occasion de développer vos propres recherches dans le cadre de la recherche effectuée en laboratoire. Pour ce faire, vous devrez

• Développer des modèles de machine learning pour relier la variation morphologique et transcriptomique des dents de chauve-souris – vous développerez des modèles à partir de données morphologiques et transcriptomiques générées en laboratoire en étroite collaboration avec notre collaborateur.
• Comparer les dents et les glandes salivaires – vous étudierez l’évolution de la morphologie et du transcriptome des glandes salivaires de la chauve-souris et comparerez ces résultats aux dents pour étudier la co-évolution de deux organes liés au régime alimentaire.
• Collecter des échantillons sur le terrain (Trinidad, République dominicaine) dans le cadre d’une expédition intensive sur le terrain exigeant de longues heures de travail la nuit dans des endroits éloignés.
• Collaborer avec un réseau international de collaborateurs
• Communiquer vos résultats – partager vos résultats par le biais de publications, de présentations lors de conférences internationales et de rapports

Compétences

• Expérience en machine learning et en modélisation
• Analyses bioinformatiques de données transcriptomiques : cartographie du génome, assemblage
• Analyses statistiques de données transcriptomiques : analyses comparatives entre stades de développement consécutifs et comparaison interspécifique dans un cadre phylogénétique contraint
• Maîtrise des langages R ou python
• Revue de la littérature des méthodes applicables
• Maîtrise de l’anglais
• Les compétences d’outdoor (randonnée, escalade, spéléologie) seront un atout
• Une connaissance des méthodes morphologiques (segmentation sur scanners, landmarking, morphométrie géométrique) sera un atout

Les candidats devront être titulaires d’un doctorat ou d’un diplôme équivalent dans une discipline connexe (biologie évolutive ou bioinformatique), avec une expérience en apprentissage automatique.Contexte de travailLe candidat rejoindra le groupe NOVELTEETH dirigé par le Dr A. Sadier (CNRS) au sein de l’équipe Macroévolution et Développement (https://isem-evolution.fr/equipe/equipe-macroevolution-et-developpement/), coordonnée par le Dr C. Martinand-Mari (CNRS) au sein de l’unité de recherche Institut des Sciences de l’évolution de Montpellier (ISE-M). Vous travaillerez dans un environnement convivial dans la belle ville de Montpellier. Le laboratoire est très collaboratif et vous bénéficierez de l’expertise de chercheurs de renommée mondiale en paléontologie, en génomique, en biologie évolutive et en écologie.Contraintes et risquesRisques liés au travail sur écran et de laboratoire.
En terrain, risques liés au travail en milieu hostile (jungle, grottes, milieu tropical) exigeant de longues heures de travail de nuit lors des missions de terrain.

Expected salary

€3021.5 per month

Location

Montpellier

Job date

Thu, 01 Aug 2024 03:10:02 GMT

To help us track our recruitment effort, please indicate in your email/cover letter where (vacanciesineu.com) you saw this job posting.